元代至元十三年（1276），改邵武军为邵武路。明洪武元年（1368），又改路为府。清仍明制，建宁县属邵武府。
民国元年（1912），撤邵武府，在南平设北路观察使，不久，改为建安道，建宁属之。民国17年，实行新制，废建宁道，建宁直属福建省政府。
第二次国内革命战争时期，建宁县在民国20年至23年建立苏维埃政权。初属江西省苏维埃，民国22年4月，划归闽赣省革命委员会领导，并一度成为闽赣省苏维埃政府所在地。
民国23年，国民党政府将建宁划归第九行政督察专员公署（邵武）管辖。次年，改隶第七专员公署（长汀）。民国29年起，划归第二专员公署（南平）管辖，直至1950年2月建宁解放。
解放后，1950～1970年6月，隶属福建省人民政府南平专员公署。1970年7月，划归三明地区。1983年，三明改为省辖市，建宁为市辖县。
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